BHQ-3 acid 是一種高效的非熒光淬滅劑，屬于黑洞猝滅劑（Black Hole Quencher, BHQ）系列中的羧酸活性衍生物，以下是關于其詳細介紹：

一、基本信息

• 中文名稱：BHQ-3酸、黑洞猝滅劑-3酸、BHQ-3羧酸

• 英文名稱：BHQ-3 acid

• CAS號：1338332-66-3

• 分子式：C33H35N6O2+

• 分子量：547.68

• 外觀：深紫色至黑色固體粉末

結構式：

二、化學結構與性質

• 核心結構：BHQ-3 acid的核心結構為高度共軛的芳香族系統，能夠吸收620-730nm范圍內的光能，而不會發射可檢測熒光，實現高效淬滅。

• 羧酸基團：分子中的羧酸基團（-COOH）為化學修飾提供了位點，可通過活化形成NHS酯或其他可偶聯基團，與蛋白質、多肽或寡核苷酸反應，構建穩定的熒光-淬滅體系。

• 溶解性：易溶于極性有機溶劑（如DMSO、DMF、乙醇等），在水中溶解性較好，便于在水溶液體系中操作。

• 穩定性：在干燥、避光條件下穩定，可長期儲存。在水溶液或活化條件下需短期使用，以保證反應效率。在中性至弱堿性緩沖條件下穩定，適合生物實驗環境和FRET探針構建體系。

三、功能特性

• 高效熒光淬滅：BHQ-3 acid的淬滅機制為靜態淬滅與動態淬滅結合，淬滅效率高，且自身無熒光發射，不會產生背景熒光干擾。

• 寬吸收譜：吸收波段寬，可兼容多種紅光和近紅外熒光標記，實現靈活的實驗設計。

• 化學可修飾性：羧酸基團可通過水溶性活化劑（如EDC/NHS）與氨基共價結合，構建穩定酰胺鍵，反應條件溫和，對生物大分子活性影響小。

• 水溶性與生物兼容性：酸性形式改善水溶性，降低在水溶液中自聚或沉淀的風險，適用于生物體系。

四、應用領域

• 熒光探針研發：BHQ-3 acid常用于寡核苷酸探針（如TaqMan探針、分子信使探針）設計，通過FRET實現靶序列檢測。熒光染料與BHQ-3之間的能量轉移在無靶標存在時保持淬滅狀態，靶標結合后熒光信號恢復，實現高信噪比檢測。

• 實時熒光定量PCR（qPCR）：在qPCR探針中廣泛應用，通過FRET效應對紅色或遠紅熒光染料進行淬滅。實驗過程中，DNA聚合酶的5'→3'外切活性切割探針時，熒光染料與BHQ-3分離，熒光信號增強，實現靶序列的實時定量。

• 酶動力學和活性檢測：可用于設計熒光報告底物，檢測酶切或蛋白相互作用，通過熒光恢復定量分析酶活性。

• 多重熒光檢測：由于BHQ-3主要淬滅紅光至近紅外光熒光，適用于多通道熒光實驗，避免信號串擾，實現多重標記檢測。

• 生物傳感器構建：可與功能性納米材料、熒光染料和生物識別分子結合，開發高靈敏度的生物傳感器。

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